MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Marinithermus hydrothermalis DSM 14884 chromosome

Total Repeats: 52970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015387	CCA	2	6	130473	130478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949671
3002	NC_015387	GGC	2	6	130488	130493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949671
3003	NC_015387	GCA	2	6	130503	130508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949671
3004	NC_015387	GCC	3	9	130517	130525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949671
3005	NC_015387	TCC	2	6	130526	130531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949671
3006	NC_015387	GCCC	2	8	130544	130551	0 %	0 %	25 %	75 %	328949671
3007	NC_015387	TGG	2	6	130602	130607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949671
3008	NC_015387	TCG	2	6	130668	130673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949671
3009	NC_015387	CGGTAC	2	12	130808	130819	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	328949671
3010	NC_015387	TCGC	2	8	130820	130827	0 %	25 %	25 %	50 %	328949671
3011	NC_015387	CCCA	2	8	130877	130884	25 %	0 %	0 %	75 %	328949671
3012	NC_015387	GCC	2	6	130986	130991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949671
3013	NC_015387	C	7	7	131056	131062	0 %	0 %	0 %	100 %	328949671
3014	NC_015387	CTCCA	2	10	131081	131090	20 %	20 %	0 %	60 %	328949671
3015	NC_015387	CGA	2	6	131094	131099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949671
3016	NC_015387	GC	3	6	131115	131120	0 %	0 %	50 %	50 %	328949671
3017	NC_015387	CG	3	6	131148	131153	0 %	0 %	50 %	50 %	328949671
3018	NC_015387	TGA	2	6	131154	131159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949671
3019	NC_015387	CGT	2	6	131172	131177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949671
3020	NC_015387	CGG	2	6	131192	131197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949671
3021	NC_015387	CCA	2	6	131283	131288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949671
3022	NC_015387	GCGCG	2	10	131349	131358	0 %	0 %	60 %	40 %	328949671
3023	NC_015387	CTC	2	6	131389	131394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949671
3024	NC_015387	TCGC	2	8	131426	131433	0 %	25 %	25 %	50 %	328949671
3025	NC_015387	GAG	2	6	131452	131457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949671
3026	NC_015387	GAT	2	6	131485	131490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949671
3027	NC_015387	CAC	2	6	131503	131508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949671
3028	NC_015387	GGTGG	2	10	131524	131533	0 %	20 %	80 %	0 %	328949671
3029	NC_015387	G	7	7	131554	131560	0 %	0 %	100 %	0 %	328949671
3030	NC_015387	CGTG	2	8	131562	131569	0 %	25 %	50 %	25 %	328949671
3031	NC_015387	TTC	2	6	131614	131619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949671
3032	NC_015387	T	6	6	131653	131658	0 %	100 %	0 %	0 %	328949671
3033	NC_015387	GCCG	2	8	131670	131677	0 %	0 %	50 %	50 %	328949671
3034	NC_015387	GCCG	2	8	131695	131702	0 %	0 %	50 %	50 %	328949671
3035	NC_015387	GAA	2	6	132520	132525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949672
3036	NC_015387	TCGGC	2	10	132576	132585	0 %	20 %	40 %	40 %	328949672
3037	NC_015387	GCCG	2	8	132601	132608	0 %	0 %	50 %	50 %	328949672
3038	NC_015387	ATC	2	6	132653	132658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949672
3039	NC_015387	GGC	2	6	132712	132717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949672
3040	NC_015387	TCA	2	6	132720	132725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949672
3041	NC_015387	GAG	2	6	132752	132757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949672
3042	NC_015387	CGC	2	6	132817	132822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949672
3043	NC_015387	CTC	2	6	132829	132834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949672
3044	NC_015387	CGC	2	6	132868	132873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949672
3045	NC_015387	GAC	2	6	132881	132886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949672
3046	NC_015387	GCC	2	6	132902	132907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949672
3047	NC_015387	TGCG	2	8	132918	132925	0 %	25 %	50 %	25 %	328949672
3048	NC_015387	GCC	2	6	132989	132994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949672
3049	NC_015387	GCA	2	6	133027	133032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949672
3050	NC_015387	AGC	2	6	133041	133046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949672
3051	NC_015387	TGG	2	6	133086	133091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949672
3052	NC_015387	GCCA	2	8	133217	133224	25 %	0 %	25 %	50 %	328949672
3053	NC_015387	GGT	2	6	133231	133236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949672
3054	NC_015387	GAG	2	6	133502	133507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949672
3055	NC_015387	AAGG	2	8	133523	133530	50 %	0 %	50 %	0 %	328949672
3056	NC_015387	CGAC	2	8	133533	133540	25 %	0 %	25 %	50 %	328949672
3057	NC_015387	GTCTCC	2	12	133541	133552	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	328949672
3058	NC_015387	CGG	2	6	133594	133599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949672
3059	NC_015387	ACGCGG	2	12	133674	133685	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	328949672
3060	NC_015387	TCT	2	6	133695	133700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949672
3061	NC_015387	TCT	2	6	133722	133727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949672
3062	NC_015387	ACG	2	6	133803	133808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949672
3063	NC_015387	GCG	2	6	133818	133823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949672
3064	NC_015387	CGA	2	6	133891	133896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949672
3065	NC_015387	GC	3	6	133922	133927	0 %	0 %	50 %	50 %	328949672
3066	NC_015387	CCA	2	6	133932	133937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949672
3067	NC_015387	ACA	2	6	133947	133952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949672
3068	NC_015387	AAC	2	6	133997	134002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949672
3069	NC_015387	GCG	2	6	134064	134069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949672
3070	NC_015387	CGC	2	6	134095	134100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949672
3071	NC_015387	TCG	2	6	134118	134123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949672
3072	NC_015387	TCGAGC	2	12	134130	134141	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	328949672
3073	NC_015387	CGG	2	6	134163	134168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949672
3074	NC_015387	GCG	2	6	134247	134252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949672
3075	NC_015387	CGA	2	6	134386	134391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949672
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3077	NC_015387	CTT	2	6	134542	134547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949672
3078	NC_015387	ACC	2	6	134552	134557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949672
3079	NC_015387	GCG	2	6	134565	134570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949672
3080	NC_015387	ACGCCG	2	12	134586	134597	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	328949672
3081	NC_015387	CCA	2	6	134616	134621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949672
3082	NC_015387	ACG	2	6	134646	134651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949672
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3084	NC_015387	CG	3	6	134692	134697	0 %	0 %	50 %	50 %	328949672
3085	NC_015387	GAC	2	6	134726	134731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949672
3086	NC_015387	CAT	2	6	134773	134778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949672
3087	NC_015387	CTTCCG	2	12	134794	134805	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	328949672
3088	NC_015387	GCG	2	6	134814	134819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949672
3089	NC_015387	CAC	2	6	134833	134838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	328949672
3090	NC_015387	CGAGC	2	10	134884	134893	20 %	0 %	40 %	40 %	328949672
3091	NC_015387	GCA	2	6	134916	134921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949672
3092	NC_015387	ACA	2	6	134928	134933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949672
3093	NC_015387	CTA	2	6	134956	134961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949672
3094	NC_015387	CAA	2	6	134977	134982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949672
3095	NC_015387	CAA	2	6	135043	135048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949672
3096	NC_015387	CGG	2	6	135087	135092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949672
3097	NC_015387	CTA	2	6	135157	135162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949672
3098	NC_015387	ACA	2	6	135198	135203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949672
3099	NC_015387	CGGC	2	8	135388	135395	0 %	0 %	50 %	50 %	328949673
3100	NC_015387	TGG	2	6	135424	135429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949673
3101	NC_015387	CG	3	6	135430	135435	0 %	0 %	50 %	50 %	328949673
3102	NC_015387	ACCC	2	8	135480	135487	25 %	0 %	0 %	75 %	328949673
3103	NC_015387	CCT	2	6	135503	135508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949673
3104	NC_015387	GCC	2	6	135532	135537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949673
3105	NC_015387	GAG	2	6	135540	135545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949673
3106	NC_015387	GCC	2	6	135546	135551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949673
3107	NC_015387	GCC	2	6	135564	135569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949673
3108	NC_015387	CTA	2	6	135596	135601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949673
3109	NC_015387	GCC	2	6	135613	135618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949673
3110	NC_015387	GC	3	6	135662	135667	0 %	0 %	50 %	50 %	328949673
3111	NC_015387	CG	3	6	135689	135694	0 %	0 %	50 %	50 %	328949673
3112	NC_015387	CGCGG	2	10	135737	135746	0 %	0 %	60 %	40 %	328949673
3113	NC_015387	GCC	2	6	135840	135845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949673
3114	NC_015387	C	6	6	135879	135884	0 %	0 %	0 %	100 %	328949673
3115	NC_015387	GGGC	2	8	135916	135923	0 %	0 %	75 %	25 %	328949673
3116	NC_015387	CGGG	2	8	135941	135948	0 %	0 %	75 %	25 %	328949673
3117	NC_015387	GCT	2	6	135977	135982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949673
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3119	NC_015387	GACG	2	8	136207	136214	25 %	0 %	50 %	25 %	328949674
3120	NC_015387	ACCGGA	2	12	136244	136255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949674
3121	NC_015387	GCCC	2	8	136292	136299	0 %	0 %	25 %	75 %	328949674
3122	NC_015387	CGC	2	6	136330	136335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949674
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3153	NC_015387	G	6	6	137451	137456	0 %	0 %	100 %	0 %	328949674
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